Сад появился благодаря владельцу крупнейшего в Тюмени кожевенного завода, купцу 1 гильдии — Филимону Степановичу Колмогорову.
Французский кругосветный путешественник Эдмон Котто так писал о визите в Тюмень и о знакомстве с купцом Колмогоровым:
«…затем мы отправляемся в его сад, расположенный в версте от усадьбы, в чистом поле, на берегу реки. Этот сад представляет собой прямоугольный участок земли, обнесенный забором, весь засаженный липами и березами, и с беседкой в центре».
Здесь также росли лиственницы. Липам и лиственницам, дожившим до наших дней, сейчас должно быть около ста двадцати лет.
В начале 20 века, после смерти Ф. С. Колмогорова, его потомки хотели продать сад под сруб. Так как некому было за ним ухаживать. Но сад остался жить. И долгое время он существовал. По-старинке, его называли Колмогоровским.
В советские годы на его территории находилась школа № 11. Из-за ветхого состояния школу снесли летом 2013 года. На территории сада осталась хоккейная коробка и остатки фундамента школы. Пока существовала школа, за садом следили, ухаживали за деревьями, высадили дополнительно березовую аллею. Здесь гуляли, устраивали игры, школьные мероприятия.
Сейчас Колмогоровский сад — это поле с травой и разнообразными деревьями. Еще сохранилась небольшая аллея Колмогоровских деревьев.